Лаборатория геномных исследований и селекции животных

Год создания: 2019
(Переименована в отдел геномных исследований и селекции животных в 2022 г. В состав отдела вошла лаборатория молекулярно-генетической экспертизы (Свидетельство о регистрации в государственном племенном регистре Серия ПЖ 77 № 008936 от 19 декабря 2018 г.))

Создана в 2019 году в рамках национального проекта «Наука и университеты».

Руководитель – доктор ветеринарных наук Соколова Ольга Васильевна. Кадровый потенциал – 12 сотрудников, в том числе 3 доктора наук, 5 кандидатов наук.

Цель работы - осуществление научно-исследовательских работ с применением молекулярно-генетических методов и иных инновационных технологий, направленных на разработку подходов маркерной и геномной селекции крупного рогатого скота для ускорения селекционного процесса в популяциях животных, генетического мониторинга накопления гомозиготности и рецессивных мутаций; проведение научно-исследовательских работ в области молекулярной диагностики в ветеринарной микробиологии и вирусологии, филогенетических исследований и генотипирования микроорганизмов.

Основные направления исследований:

Изучение генетической структуры популяции крупного рогатого скота для создания фундаментальных основ маркер-ориентированной и геномной селекции животных, направленной на повышение продуктивности и адаптационного потенциала животных.
Создание панелей генетических маркеров, ассоциированных с племенной ценностью животных, продуктивным долголетием и устойчивостью к заболеваниям.
Изучение генетических механизмов формирования патологического процесса вирусных и бактериальных инфекций у продуктивных сельскохозяйственных животных и новых подходов к их диагностике и ликвидации.
Мониторинг распространения антибиотикорезистентных микроорганизмов, циркулирующих на животноводческих предприятиях.
Разработка диагностических панелей для идентификации генов антибиотикорезистентности, патогенности и вирулентности микроорганизмов.

Сотрудники отдела являются исполнителями по грантам РНФ и РФФИ:

Проект РФФИ и Свердловской области № 20-416-660004 «Молекулярно-генетическая и фенотипическая характеристика микробиоты репродуктивной системы крупного рогатого скота».
Проект РНФ № 22-16-00021 «Изучение ассоциаций молекулярно-генетических маркеров с ценными физиологическими признаками сельскохозяйственных животных с целью направленной селекции для повышения адаптационного потенциала и долголетия».

Значимые результаты:

Статьи в журналах, индексируемых в БД WoS или Scopus

Модоров М.В., Мартынов Н.А., Шкуратова И.А., Зайцева О.С., Соколова О.В., Ряпосова М.В. Распространение рецессивных генетических нарушений в уральской популяции крупного рогатого скота / Генетика. – 2022. – Т. 58. – №4. – С. 429-437. DOI: 10.31857/S0016675822040105
O.V. Sokolova, N.A. Bezborodova, М.V. Bytov, V.D. Zubareva, I.A. Shkuratova, О.S. Zaitseva, N.A. Martynov. Comparison of the Microbiota of the Reproductive Tract and the Mammary Gland of Cows with and without Inflammation Using 16S rRNA Sequencing / International Transaction Journal of Engineering, Management, & Applied Sciences & Technologies. 2022. – Issues 13. Vol.6. https://tuengr.com/A13/13A6/13A6C.html
Sokolova O.V., Bezborodova N.A., Lysova Y.Y., Pechura E.V. Characteristics of species composition, biochemical and pathogenic nature of the microbiota of mammary gland and the reproductive tract in dairy cows / International Conference “Ensuring Food Security in the Context of the COVID-19 Pandemic” (EFSC2021). – 2021. – V. 282. – 10 p. DOI https://doi.org/10.1051/e3sconf/202128203017.
Bezborodova N.A., Sokolova O.V., Shkuratova I.A., Ryaposova M.V., Lysova Ya.Yu., Isakova M.N., Kozhukhovskaya V.V. Sensitivity and resistance of the microbiota of reproductive organs and mammary gland of cows to anti-microbial agents in cases of inflammation / International journal of biology and biomedical engineering. – 2020. – V. 14. – P. 49-54. DOI: 10.46300/91011.2020.14.8

Статьи в журналах, индексируемых в ядре РИНЦ

Исакова М.Н., Соколова О.В., Безбородова И.А., Кривоногова А.С., Исаева, A. Г., Зубарева В.Д. Антибиотикорезистентность клинических изолятов Escherichia coli, выделенных от животных / Ветеринария сегодня. – 2022. – Т. 11. – № 1. – С. 14-19. – DOI 10.29326/2304-196X-2022-11-1-14-19.
Зайцева О.С., Безбородова Н.А., Кожуховская В.В., Мартынов Н.А. Оценка аллельных вариантов гена каппа-казеина у коров черно-пестрой породы на территории Свердловской области / Труды Кубанского государственного аграрного университета. – 2021. – № 93. – С. 276-279. – DOI 10.21515/1999-1703-93-276-279. – EDN JWOEDZ.
Кривоногова А.С., Исаева А.Е., Соколова О.В., Безбородова Н.А., Моисеева К.В. Динамика антимикробной резистентности энтерококков на молочно-товарной ферме / Ветеринария Кубани. - №4. - 2021. DOI 10.33861/2071-8020-2021-4-9-12. ISSN 2071-8020. Тираж 6000.
Безбородова Н.А., Соколова О.В., Кривоногова А.С., Исаева А.Е., Зубарев, B. Д., Кожуховская В.В. Фенотипическая и генотипическая антибиотикорезистентность бактерий семейства Enterobacteriaceae, выделенных в сельскохозяйственных предприятиях Уральского региона / Труды Кубанского ЕАУ. - 2021. - № 92. - С.201-210. ISSN 1999-1703.
Krivonogova A. S., Isaeva A. G., Sokolova О. V., Moiseeva К. V. Profiles of antimicrobial resistance of enterobacteria isolated at livestock enterprises of the Ural region / Agrarian Bulletin of the Urals. - 2021. -No 8(211). -P. 36-41. - DOI 10.32417/1997-4868-2021- 211-08-36-41. ISSN 1997-4868. Тираж 2000.
Sokolova O.V., Shkuratova I.A., Bezborodova N.A., Kozhukhovskaya V.V. Антибиотикорезистентность микробиоты молочной железы и репродуктивного тракта коров / Ветеринария. – 2021. – №9. – С.10-15.
Barkova A.S., Makutina V.A., Modorov M.V., Isaeva A.G., Krivonogova A.S. Features of the preparation of biological material for genome editing in cattle \\ Agrarian bulletin of the Urals. – 2019. – № 12 (191). – P. 40-44.

Статьи в журналах, рецензируемых ВАК

Мартынов Н.А., Модоров М.В., Соколова О.В., Бытов М.В., Зайцева О.С., Безбородова Н.А., Зубарева В.Д., Кожуховская В.В., Шкуратова И.А. Молекулярно-генетическая оценка распространённости дефицита фактора свёртываемости крови в уральской популяции голштинизированного чёрно-пёстрого скота / Проблемы биологии продуктивных животных. – 2022. – № 1. – С. 54-61. – DOI 10.25687/1996-6733.prodanimbiol.2022.1.54-61.
Баранова, А.А., Юсупова Ч.Р., Грин А.А., Ряпосова М.В., Модоров М.В. Оценка частоты встречаемости гаплотипа фертильности HCD в популяции голштинизированного черно-пестрого скота на территории Урала / А. А. Баранова, Ч. Р. Юсупова, А. А. Грин и др. // Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. – 2021. – № 1. – С. 89-91. – DOI 10.17238/issn2072-6023.2021.1.89. ISSN 2072-6023. Тираж 1000.
Кожуховская В. В., Зайцева О. С., Мартынов Н. А., Зубарева В. Д. Летальные гаплотипы в популяции голштинского крупного рогатого скота и их роль в воспроизводстве (обзор) / Животноводство и кормопроизводство. – 2021. – Т. 104. – № 3. – С. 155-166. – DOI 10.33284/2658-3135-104-3-155.
Модоров М. В., Ткаченко И. В., Грин А. А. Индивидуальная идентификация особей и контроль родословной в популяции голштинизированного черно-пестрого скота Урала / М. В. Модоров, // Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. – 2019. – № 4. – С. 119-121. – DOI 10.17238/issn2072-6023.2019.4.119.
Модоров М. В., Ткаченко И. В., Грин А. А. Генетическая изменчивость голштинизированного черно-пестрого скота на территории Свердловской области / М. В. Модоров, И. В. Ткаченко, А. А. Грин // Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. – 2019. – № 4. – С. 111-113. DOI 10.17238/issn2072-6023.2019.4.111.

Лаборатория сотрудничает с Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (г. Новосибирск), Томским национальным исследовательским медицинским центром (г.Томск), ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста (г.Подольск), МЦ Кволити Мед (г.Екатеринбург), ООО «Интерлабсервис».